De Faculteit voor Protestantse Theologie en Religiewetenschappen (FPTR) is een van ambtshalve erkende instelling voor hoger onderwijs die geaccrediteerde opleidingen aanbiedt in de theologie en religiewetenschappen.

Onderstaand schema vermeldt door wie en wanneer de evaluatie van de kwaliteit wordt uitgevoerd. De verschillende deelgebieden staan in de linker verticale kolom, de praktische afspraken in de horizontale rijen. 

Het is van belang op te merken dat ook de Academische Raad van de FPTR intern toezicht en controle uitoefent op de kwaliteit van scripties, modules en doctoraten. Dit komt jaarlijks twee keer ter vergadering tijdens de deliberaties. Mogelijke verbeterpunten worden besproken, waarna een procedure de implementering faciliteert.